维持现行13%、9%、6%三档税率不变，对部分货物、服务出口适用零税率；规定增值税的计税方法，界定销项税额、进项税额及销售额；明确简易计税方法的征收率以及进口货物应纳税额的计算方法等。

设定了小规模纳税人纳税起征点；列举了法定免税项目，并授权国务院规定具体标准；授权国务院制定增值税专项优惠政策，报全国人大常委会备案。

明确增值税由税务机关征收，进口货物的增值税由海关代征，并对增值税的纳税义务发生时间、纳税地点、计税期间、扣缴义务人等作了规定。

与关税法相衔接，对进口货物增值税的征收管理作出规定；与全国人大常委会有关决定相衔接，对由国务院制定中外合作开采海洋石油、天然气增值税的计税方法等作出规定。